Accueil Publications médicales Bibliographie : collecte annuelle sur Medline-MeSH d’articles publiés sur une maladie

Publié le : 2 novembre 2004
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Auteur :
François Besançon

François Besançon
Bibliographie : collecte annuelle sur Medline-MeSH d’articles publiés sur une maladie
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Collecte annuelle sur Medline-MeSH d’articles publiés sur une maladie. Tour à tour seront abordées la prospection, la sélection et l’exploitation.

Prospection

Cette recherche se limite aux articles. Rechercher les livres demande une autre technique. Quant aux résumés des communications orales ou affichées dans les congrès, ils resteront introuvables en dehors des actes des congrès jusqu’à ce qu’ils soient acceptés ailleurs comme articles.

La première démarche est de traduire le nom de la maladie dans le mot-clé anglais du MeSH , grâce à : http://disc.vjf.inserm.fr:2010/basismesh/meshv04.html

Prenons l’exemple d’Alcoholism, visité annuellement en octobre de manière à ce que l’année précédente ait eu le temps d’être entièrement répertoriée :
- Préparer un document texte vide en simple interligne, aligné à gauche, avec marges latérales de 1,5 cm et l’intituler par exemple Alcool MeSH 03-04.1. Par “Enregistrer sous”, le multiplier en Alcool MeSH 03-04.2, Alcool MeSH 03-04.3 etc. Il en faudra environ un pour 400 résumés d’articles.
- Ouvrir MeSH par http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi ?db=mesh , taper Alcoholism, clic sur Go.
- Dans la Page obtenue, cliquer la case et le mot Alcoholism.
- Dans la Page obtenue, cliquer les cases des catégories qui vous intéressent, les Subheadings : par exemple Classification, Complications... qs .... Therapy. Clic sur Display.
- Sur l’écran obtenu, clic sur Search Pubmed.
- Dans la Page obtenue, remarquer en haut, en petits caractères : Limits. Clic sur Limits.
- Dans la Page obtenue, à Publication Date, indiquer la période choisie, par exemple From 20030101 To 20041003. Clic sur Go
- Dans la Page obtenue, glisser de Summary à Abstract. Après Show, glisser sur100. Clic sur Display.

Merveille : les 100 premiers abstracts apparaissent, précédés de la mention Items 1-100 of 1603 et de l’annonce d’un total de 17 pages, chacune de 100 abstracts. Sélectionner entièrement la page obtenue. La copier-coller dans le document texte Alcool MeSH 03-04.1. Enregistrer. Toujours sur la page des 100 premiers Abstracts, clic sur Next, pour avoir les 100 suivants à copier-coller.

Cela, jusqu’à un refus de coller sous forme du message “mémoire saturée”. C’est dans le traitement de texte que la mémoire est saturée et non dans le presse-papier.

Au lieu de fermer la page Alcool MeSH 03-04.1, la quitter pour quitter le traitement de texte. Ouvrir la page prête Alcool MeSH 03-04.2 et y coller la liste qui attendait dans le presse-papier. Et ainsi de suite.

On aurait pu choisir d’afficher par lots de 200 ou de 500 abstracts. À l’essai, ça coince bientôt sur un portable Mac Ibook et il faut le redémarrer. On aurait pu choisir encore d’utiliser "Send to" en glissant de Text sur File. L’avantage est de télécharger d’un coup les 1603 abstracts, mais le fichier query obtenu a détruit la belle mise en pages des abstracts. Lire leurs titres devient un casse-tête. Instructions plus détaillées dans : http://www.ccr.jussieu.fr/urfist/biolo/bioguide2/medline/new_pubmed1.htm

Sélection

Quitter MeSH et déconnecter d’Internet. Avant de parcourir les titres dans les pages copiées, préparer dans le traitement de texte une Page vide nommée Alcool.Sélection 03-04.

Y copier-coller les seuls abstracts dignes d’être élus. Sauvegarder cette sélection et détruire les Pages copiées MeSH, sachant qu’elles sont conservées par Medline. Imprimer cette sélection pour inscrire en marge des abstracts comment on les exploite (voir ci-après) : répertoriage ; demande de tiré à part par courriel ou par poste ; addenda à telle publication.

Exploitation

Pour recevoir les textes in extenso des articles, demander les tirés à part (reprints) aux auteurs, leurs adresses électroniques ou postales figurant avec l’Abstract. Par exemple :

Dear Dr. ..., I should greatly appreciate receiving a reprint of your article entitled :
published in...
and of your other studies on the subject.
With many thanks,
Sincerely yours.

Terminer par votre adresse électronique et votre adresse postale, celle-ci répétée sur deux colonnes. Ils en découperont une pour la coller sur l’enveloppe s’ils choisissent la voie postale.

Les abstracts élus portent des numéros qui vous permettront des les répertorier dans votre base de données.
La fine fleur d’entre eux servira à amender votre pratique médicale ainsi que vos publications ou votre site Internet voués à ladite maladie.

Auteur : Dr. François Besançon, MMT




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